優(yōu)點是在胚胎發(fā)育至囊胚的過程中，自然淘汰掉了一些品質不好的胚胎，最后剩下能夠發(fā)育到囊胚的胚胎移植回子宮。這樣可以提高每次移植后成功著床率，減少每次移植回子宮的胚胎數(shù)量，降低多胞胎妊娠的風險。對于不需要生寶寶的夫婦來說，可以只移植一個囊胚，而著床率與移植兩個囊胚差不多。

缺點是囊胚培養(yǎng)過程對實驗室要求比較高，并且對于卵子數(shù)目特別少的女性，囊胚培養(yǎng)的困難也較高。如果要讓囊胚移植的成功率高于移植初級胚胎，要求具備特殊的胚胎培養(yǎng)系統(tǒng)，以及標準的胚胎培養(yǎng)實驗室。在某些情況下，在細胞發(fā)育到初級胚胎時進行胚胎移植的成功率也不錯。因為胚胎需要在子宮外的非自然環(huán)境下培養(yǎng)，如果實驗室條件不達標，胚胎可能因受到外界環(huán)境影響而不能發(fā)育到囊胚階段，最后沒有胚胎可移植回子宮。

囊胚比例和女性年齡有關，年齡小的女性相比年齡大的女性能夠得到囊胚的比例高。35歲以下的女性，囊胚占受精胚胎的比例約為50%，隨著年齡的增加而降低。

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